Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASP7P55210 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASP7P55210 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASP7P55210 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASP7P55210 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASP7P55210 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASP7P55210 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASP7P55210 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASP7P55210 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASP7P55210 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASP7P55210 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASP7P55210 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASP7P55210 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASP7P55210 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASP7P55210 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASP7P55210 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASP7P55210 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASP7P55210 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASP7P55210 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASP7P55210 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASP7P55210 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASP7P55210 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASP7P55210 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASP7P55210 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CASP7P55210 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CASP7P55210 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CASP7P55210 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CASP7P55210 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CASP7P55210 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CASP7P55210 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CASP7P55210 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CASP7P55210 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CASP7P55210 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CASP7P55210 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CASP7P55210 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CASP7P55210 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASP7P55210 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASP7P55210 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASP7P55210 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASP7P55210 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASP7P55210 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASP7P55210 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASP7P55210 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASP7P55210 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASP7P55210 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASP7P55210 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASP7P55210 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASP7P55210 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASP7P55210 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASP7P55210 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASP7P55210 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASP7P55210 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASP7P55210 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASP7P55210 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASP7P55210 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASP7P55210 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASP7P55210 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASP7P55210 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASP7P55210 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASP7P55210 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASP7P55210 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASP7P55210 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASP7P55210 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASP7P55210 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASP7P55210 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASP7P55210 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASP7P55210 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASP7P55210 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASP7P55210 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASP7P55210 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASP7P55210 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CASP7P55210 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASP7P55210 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASP7P55210 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASP7P55210 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASP7P55210 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASP7P55210 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASP7P55210 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASP7P55210 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASP7P55210 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASP7P55210 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASP7P55210 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASP7P55210 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASP7P55210 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASP7P55210 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASP7P55210 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CASP7P55210 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASP7P55210 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASP7P55210 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASP7P55210 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASP7P55210 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASP7P55210 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASP7P55210 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASP7P55210 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASP7P55210 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASP7P55210 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASP7P55210 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASP7P55210 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASP7P55210 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASP7P55210 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms