Protein–RNA interactions for Protein: P54845

NRL, Neural retina-specific leucine zipper protein, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRLP54845 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NRLP54845 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NRLP54845 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NRLP54845 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NRLP54845 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NRLP54845 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NRLP54845 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NRLP54845 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NRLP54845 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NRLP54845 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NRLP54845 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NRLP54845 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NRLP54845 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NRLP54845 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NRLP54845 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NRLP54845 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NRLP54845 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NRLP54845 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NRLP54845 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NRLP54845 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NRLP54845 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NRLP54845 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NRLP54845 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NRLP54845 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NRLP54845 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NRLP54845 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NRLP54845 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NRLP54845 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NRLP54845 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NRLP54845 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NRLP54845 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NRLP54845 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NRLP54845 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NRLP54845 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NRLP54845 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NRLP54845 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NRLP54845 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NRLP54845 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NRLP54845 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NRLP54845 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NRLP54845 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRLP54845 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRLP54845 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRLP54845 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRLP54845 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRLP54845 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRLP54845 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRLP54845 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRLP54845 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRLP54845 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRLP54845 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRLP54845 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRLP54845 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRLP54845 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRLP54845 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRLP54845 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRLP54845 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRLP54845 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRLP54845 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRLP54845 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRLP54845 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRLP54845 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRLP54845 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRLP54845 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRLP54845 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRLP54845 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRLP54845 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRLP54845 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRLP54845 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRLP54845 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRLP54845 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRLP54845 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRLP54845 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRLP54845 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRLP54845 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRLP54845 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRLP54845 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRLP54845 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRLP54845 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRLP54845 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRLP54845 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRLP54845 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRLP54845 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRLP54845 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NRLP54845 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRLP54845 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRLP54845 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRLP54845 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRLP54845 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRLP54845 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRLP54845 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRLP54845 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRLP54845 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRLP54845 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRLP54845 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRLP54845 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NRLP54845 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NRLP54845 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NRLP54845 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NRLP54845 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms