Protein–RNA interactions for Protein: P54253

ATXN1, Ataxin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN1P54253 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATXN1P54253 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATXN1P54253 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATXN1P54253 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ATXN1P54253 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATXN1P54253 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATXN1P54253 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATXN1P54253 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATXN1P54253 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATXN1P54253 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATXN1P54253 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATXN1P54253 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ATXN1P54253 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATXN1P54253 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATXN1P54253 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATXN1P54253 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATXN1P54253 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATXN1P54253 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATXN1P54253 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATXN1P54253 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATXN1P54253 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATXN1P54253 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATXN1P54253 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATXN1P54253 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATXN1P54253 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATXN1P54253 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATXN1P54253 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATXN1P54253 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATXN1P54253 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATXN1P54253 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ATXN1P54253 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATXN1P54253 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATXN1P54253 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATXN1P54253 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATXN1P54253 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ATXN1P54253 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATXN1P54253 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATXN1P54253 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATXN1P54253 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATXN1P54253 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATXN1P54253 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms