Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
NKX2-5P52952 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NKX2-5P52952 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms