Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
SMARCA2P51531 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC36.69■■■■□ 3.46
SMARCA2P51531 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
SMARCA2P51531 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
SMARCA2P51531 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
SMARCA2P51531 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
SMARCA2P51531 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
SMARCA2P51531 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
SMARCA2P51531 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
SMARCA2P51531 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
SMARCA2P51531 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
SMARCA2P51531 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
SMARCA2P51531 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
SMARCA2P51531 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
SMARCA2P51531 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
SMARCA2P51531 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
SMARCA2P51531 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
SMARCA2P51531 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
SMARCA2P51531 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
SMARCA2P51531 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
SMARCA2P51531 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
SMARCA2P51531 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
SMARCA2P51531 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
SMARCA2P51531 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
SMARCA2P51531 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC36.66■■■■□ 3.46
SMARCA2P51531 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC36.66■■■■□ 3.46
SMARCA2P51531 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
SMARCA2P51531 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
SMARCA2P51531 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
SMARCA2P51531 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
SMARCA2P51531 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
SMARCA2P51531 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
SMARCA2P51531 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
SMARCA2P51531 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC36.65■■■■□ 3.46
SMARCA2P51531 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
SMARCA2P51531 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
SMARCA2P51531 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
SMARCA2P51531 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
SMARCA2P51531 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
SMARCA2P51531 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
SMARCA2P51531 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
SMARCA2P51531 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
SMARCA2P51531 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC36.64■■■■□ 3.46
SMARCA2P51531 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
SMARCA2P51531 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC36.64■■■■□ 3.46
SMARCA2P51531 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
SMARCA2P51531 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
SMARCA2P51531 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
SMARCA2P51531 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
SMARCA2P51531 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
SMARCA2P51531 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
SMARCA2P51531 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
SMARCA2P51531 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
SMARCA2P51531 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
SMARCA2P51531 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
SMARCA2P51531 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
SMARCA2P51531 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
SMARCA2P51531 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
SMARCA2P51531 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
SMARCA2P51531 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
SMARCA2P51531 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
SMARCA2P51531 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
SMARCA2P51531 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
SMARCA2P51531 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
SMARCA2P51531 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
SMARCA2P51531 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
SMARCA2P51531 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
SMARCA2P51531 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
SMARCA2P51531 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
SMARCA2P51531 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
SMARCA2P51531 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
SMARCA2P51531 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
SMARCA2P51531 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
SMARCA2P51531 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
SMARCA2P51531 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
SMARCA2P51531 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
SMARCA2P51531 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
SMARCA2P51531 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
SMARCA2P51531 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
SMARCA2P51531 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
SMARCA2P51531 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
SMARCA2P51531 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
SMARCA2P51531 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
SMARCA2P51531 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
SMARCA2P51531 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
SMARCA2P51531 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
SMARCA2P51531 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
SMARCA2P51531 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
SMARCA2P51531 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
SMARCA2P51531 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
SMARCA2P51531 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
SMARCA2P51531 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
SMARCA2P51531 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
SMARCA2P51531 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
SMARCA2P51531 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
SMARCA2P51531 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
SMARCA2P51531 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
SMARCA2P51531 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
SMARCA2P51531 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
SMARCA2P51531 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms