Protein–RNA interactions for Protein: P50897

PPT1, Palmitoyl-protein thioesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPT1P50897 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPT1P50897 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPT1P50897 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPT1P50897 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPT1P50897 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPT1P50897 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPT1P50897 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPT1P50897 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPT1P50897 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPT1P50897 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPT1P50897 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPT1P50897 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPT1P50897 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPT1P50897 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPT1P50897 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPT1P50897 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPT1P50897 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPT1P50897 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPT1P50897 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPT1P50897 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPT1P50897 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPT1P50897 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPT1P50897 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPT1P50897 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPT1P50897 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPT1P50897 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPT1P50897 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPT1P50897 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPT1P50897 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPT1P50897 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPT1P50897 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPT1P50897 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPT1P50897 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPT1P50897 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPT1P50897 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPT1P50897 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPT1P50897 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPT1P50897 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPT1P50897 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPT1P50897 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPT1P50897 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPT1P50897 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPT1P50897 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPT1P50897 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPT1P50897 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPT1P50897 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPT1P50897 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPT1P50897 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPT1P50897 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPT1P50897 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPT1P50897 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPT1P50897 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPT1P50897 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPT1P50897 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPT1P50897 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPT1P50897 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PPT1P50897 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPT1P50897 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPT1P50897 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPT1P50897 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPT1P50897 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPT1P50897 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPT1P50897 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPT1P50897 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPT1P50897 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPT1P50897 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPT1P50897 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPT1P50897 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPT1P50897 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPT1P50897 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPT1P50897 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPT1P50897 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPT1P50897 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPT1P50897 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPT1P50897 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PPT1P50897 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PPT1P50897 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PPT1P50897 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PPT1P50897 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PPT1P50897 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPT1P50897 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPT1P50897 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPT1P50897 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPT1P50897 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPT1P50897 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPT1P50897 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPT1P50897 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPT1P50897 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPT1P50897 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPT1P50897 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPT1P50897 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPT1P50897 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPT1P50897 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPT1P50897 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPT1P50897 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPT1P50897 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPT1P50897 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPT1P50897 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPT1P50897 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PPT1P50897 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms