Protein–RNA interactions for Protein: P50613

CDK7, Cyclin-dependent kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK7P50613 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK7P50613 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK7P50613 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK7P50613 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK7P50613 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK7P50613 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK7P50613 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK7P50613 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK7P50613 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK7P50613 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK7P50613 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK7P50613 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK7P50613 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK7P50613 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK7P50613 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK7P50613 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK7P50613 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK7P50613 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK7P50613 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK7P50613 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK7P50613 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK7P50613 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK7P50613 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK7P50613 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK7P50613 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK7P50613 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK7P50613 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK7P50613 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK7P50613 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK7P50613 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK7P50613 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK7P50613 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK7P50613 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK7P50613 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK7P50613 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK7P50613 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK7P50613 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK7P50613 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK7P50613 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK7P50613 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK7P50613 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK7P50613 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK7P50613 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK7P50613 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK7P50613 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK7P50613 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK7P50613 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK7P50613 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK7P50613 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK7P50613 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK7P50613 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK7P50613 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK7P50613 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK7P50613 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK7P50613 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK7P50613 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK7P50613 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK7P50613 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK7P50613 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK7P50613 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK7P50613 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK7P50613 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK7P50613 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK7P50613 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK7P50613 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK7P50613 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK7P50613 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK7P50613 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK7P50613 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK7P50613 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK7P50613 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK7P50613 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDK7P50613 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDK7P50613 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDK7P50613 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDK7P50613 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK7P50613 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK7P50613 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK7P50613 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK7P50613 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK7P50613 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK7P50613 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK7P50613 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK7P50613 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK7P50613 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK7P50613 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK7P50613 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK7P50613 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK7P50613 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK7P50613 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK7P50613 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK7P50613 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK7P50613 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK7P50613 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK7P50613 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK7P50613 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK7P50613 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK7P50613 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK7P50613 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK7P50613 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms