Protein–RNA interactions for Protein: P49788

RARRES1, Retinoic acid receptor responder protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES1P49788 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RARRES1P49788 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RARRES1P49788 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms