Protein–RNA interactions for Protein: P49761

CLK3, Dual specificity protein kinase CLK3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK3P49761 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLK3P49761 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLK3P49761 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLK3P49761 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLK3P49761 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLK3P49761 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLK3P49761 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CLK3P49761 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLK3P49761 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLK3P49761 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLK3P49761 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLK3P49761 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLK3P49761 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLK3P49761 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLK3P49761 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLK3P49761 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLK3P49761 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLK3P49761 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLK3P49761 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLK3P49761 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLK3P49761 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLK3P49761 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLK3P49761 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLK3P49761 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLK3P49761 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLK3P49761 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CLK3P49761 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CLK3P49761 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLK3P49761 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLK3P49761 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLK3P49761 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLK3P49761 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLK3P49761 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLK3P49761 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLK3P49761 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLK3P49761 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLK3P49761 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLK3P49761 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CLK3P49761 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLK3P49761 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLK3P49761 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLK3P49761 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLK3P49761 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLK3P49761 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLK3P49761 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLK3P49761 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLK3P49761 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLK3P49761 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLK3P49761 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLK3P49761 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLK3P49761 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLK3P49761 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLK3P49761 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CLK3P49761 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLK3P49761 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLK3P49761 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLK3P49761 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLK3P49761 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLK3P49761 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLK3P49761 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CLK3P49761 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CLK3P49761 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CLK3P49761 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CLK3P49761 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLK3P49761 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLK3P49761 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLK3P49761 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLK3P49761 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLK3P49761 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLK3P49761 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLK3P49761 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLK3P49761 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLK3P49761 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLK3P49761 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLK3P49761 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLK3P49761 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLK3P49761 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLK3P49761 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLK3P49761 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLK3P49761 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLK3P49761 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLK3P49761 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLK3P49761 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLK3P49761 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLK3P49761 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CLK3P49761 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLK3P49761 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLK3P49761 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLK3P49761 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLK3P49761 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLK3P49761 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLK3P49761 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLK3P49761 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLK3P49761 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLK3P49761 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLK3P49761 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CLK3P49761 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLK3P49761 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLK3P49761 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CLK3P49761 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms