Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FNTAP49354 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FNTAP49354 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FNTAP49354 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FNTAP49354 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FNTAP49354 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FNTAP49354 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
FNTAP49354 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FNTAP49354 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FNTAP49354 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FNTAP49354 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
FNTAP49354 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
FNTAP49354 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FNTAP49354 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FNTAP49354 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FNTAP49354 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FNTAP49354 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FNTAP49354 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FNTAP49354 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FNTAP49354 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FNTAP49354 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FNTAP49354 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FNTAP49354 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
FNTAP49354 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FNTAP49354 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FNTAP49354 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FNTAP49354 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FNTAP49354 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FNTAP49354 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FNTAP49354 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FNTAP49354 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FNTAP49354 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
FNTAP49354 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FNTAP49354 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FNTAP49354 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FNTAP49354 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FNTAP49354 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FNTAP49354 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FNTAP49354 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FNTAP49354 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FNTAP49354 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FNTAP49354 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FNTAP49354 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FNTAP49354 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FNTAP49354 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FNTAP49354 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FNTAP49354 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FNTAP49354 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FNTAP49354 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FNTAP49354 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FNTAP49354 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FNTAP49354 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FNTAP49354 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FNTAP49354 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FNTAP49354 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FNTAP49354 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FNTAP49354 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FNTAP49354 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FNTAP49354 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FNTAP49354 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FNTAP49354 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FNTAP49354 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FNTAP49354 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FNTAP49354 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FNTAP49354 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FNTAP49354 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FNTAP49354 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FNTAP49354 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FNTAP49354 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FNTAP49354 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FNTAP49354 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
FNTAP49354 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FNTAP49354 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FNTAP49354 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
FNTAP49354 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FNTAP49354 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FNTAP49354 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FNTAP49354 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
FNTAP49354 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FNTAP49354 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FNTAP49354 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FNTAP49354 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
FNTAP49354 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
FNTAP49354 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FNTAP49354 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FNTAP49354 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FNTAP49354 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FNTAP49354 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FNTAP49354 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FNTAP49354 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FNTAP49354 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FNTAP49354 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FNTAP49354 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FNTAP49354 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FNTAP49354 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FNTAP49354 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FNTAP49354 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FNTAP49354 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FNTAP49354 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
FNTAP49354 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms