Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEDD4P46934 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEDD4P46934 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms