Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms