Protein–RNA interactions for Protein: P43694

GATA4, Transcription factor GATA-4, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA4P43694 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GATA4P43694 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GATA4P43694 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATA4P43694 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATA4P43694 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATA4P43694 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATA4P43694 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATA4P43694 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATA4P43694 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATA4P43694 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATA4P43694 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATA4P43694 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GATA4P43694 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATA4P43694 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATA4P43694 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATA4P43694 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GATA4P43694 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GATA4P43694 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATA4P43694 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GATA4P43694 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATA4P43694 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATA4P43694 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATA4P43694 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATA4P43694 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATA4P43694 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATA4P43694 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATA4P43694 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATA4P43694 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATA4P43694 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATA4P43694 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATA4P43694 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATA4P43694 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATA4P43694 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATA4P43694 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATA4P43694 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATA4P43694 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATA4P43694 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATA4P43694 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATA4P43694 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GATA4P43694 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATA4P43694 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATA4P43694 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATA4P43694 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATA4P43694 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATA4P43694 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATA4P43694 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATA4P43694 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATA4P43694 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATA4P43694 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATA4P43694 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATA4P43694 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATA4P43694 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATA4P43694 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATA4P43694 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATA4P43694 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATA4P43694 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATA4P43694 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATA4P43694 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATA4P43694 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATA4P43694 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATA4P43694 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATA4P43694 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATA4P43694 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATA4P43694 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATA4P43694 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATA4P43694 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GATA4P43694 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATA4P43694 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GATA4P43694 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATA4P43694 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATA4P43694 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATA4P43694 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATA4P43694 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATA4P43694 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
GATA4P43694 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
GATA4P43694 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GATA4P43694 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GATA4P43694 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GATA4P43694 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GATA4P43694 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GATA4P43694 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GATA4P43694 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GATA4P43694 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GATA4P43694 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GATA4P43694 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GATA4P43694 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GATA4P43694 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GATA4P43694 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GATA4P43694 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GATA4P43694 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GATA4P43694 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GATA4P43694 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GATA4P43694 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GATA4P43694 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GATA4P43694 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GATA4P43694 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GATA4P43694 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GATA4P43694 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GATA4P43694 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GATA4P43694 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms