Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MCAMP43121 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MCAMP43121 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MCAMP43121 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MCAMP43121 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MCAMP43121 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MCAMP43121 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MCAMP43121 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MCAMP43121 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MCAMP43121 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MCAMP43121 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MCAMP43121 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MCAMP43121 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MCAMP43121 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MCAMP43121 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MCAMP43121 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MCAMP43121 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MCAMP43121 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MCAMP43121 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MCAMP43121 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MCAMP43121 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MCAMP43121 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MCAMP43121 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MCAMP43121 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MCAMP43121 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MCAMP43121 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MCAMP43121 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MCAMP43121 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MCAMP43121 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCAMP43121 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCAMP43121 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCAMP43121 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MCAMP43121 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCAMP43121 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCAMP43121 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCAMP43121 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCAMP43121 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCAMP43121 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCAMP43121 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCAMP43121 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCAMP43121 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCAMP43121 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCAMP43121 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCAMP43121 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCAMP43121 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCAMP43121 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCAMP43121 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCAMP43121 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCAMP43121 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCAMP43121 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCAMP43121 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCAMP43121 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCAMP43121 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MCAMP43121 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCAMP43121 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCAMP43121 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCAMP43121 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCAMP43121 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCAMP43121 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCAMP43121 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCAMP43121 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCAMP43121 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCAMP43121 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCAMP43121 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCAMP43121 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MCAMP43121 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MCAMP43121 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCAMP43121 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCAMP43121 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCAMP43121 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCAMP43121 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCAMP43121 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCAMP43121 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCAMP43121 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCAMP43121 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MCAMP43121 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCAMP43121 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCAMP43121 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCAMP43121 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCAMP43121 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCAMP43121 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCAMP43121 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCAMP43121 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCAMP43121 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCAMP43121 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCAMP43121 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCAMP43121 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCAMP43121 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCAMP43121 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCAMP43121 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCAMP43121 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCAMP43121 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCAMP43121 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MCAMP43121 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCAMP43121 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCAMP43121 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MCAMP43121 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCAMP43121 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCAMP43121 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCAMP43121 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms