Protein–RNA interactions for Protein: P41222

PTGDS, Prostaglandin-H2 D-isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDSP41222 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTGDSP41222 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms