Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP8P40818 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP8P40818 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP8P40818 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP8P40818 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
USP8P40818 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP8P40818 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP8P40818 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP8P40818 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP8P40818 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP8P40818 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP8P40818 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP8P40818 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP8P40818 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP8P40818 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP8P40818 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP8P40818 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP8P40818 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP8P40818 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP8P40818 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
USP8P40818 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP8P40818 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP8P40818 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP8P40818 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP8P40818 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP8P40818 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP8P40818 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP8P40818 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP8P40818 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
USP8P40818 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP8P40818 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP8P40818 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP8P40818 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP8P40818 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP8P40818 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP8P40818 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP8P40818 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP8P40818 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP8P40818 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
USP8P40818 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP8P40818 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP8P40818 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP8P40818 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
USP8P40818 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP8P40818 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP8P40818 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP8P40818 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP8P40818 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP8P40818 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP8P40818 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP8P40818 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP8P40818 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP8P40818 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP8P40818 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP8P40818 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP8P40818 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP8P40818 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP8P40818 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP8P40818 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP8P40818 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP8P40818 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP8P40818 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP8P40818 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP8P40818 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP8P40818 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP8P40818 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP8P40818 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP8P40818 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
USP8P40818 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP8P40818 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP8P40818 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP8P40818 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP8P40818 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP8P40818 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP8P40818 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP8P40818 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP8P40818 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP8P40818 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP8P40818 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP8P40818 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP8P40818 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP8P40818 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP8P40818 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP8P40818 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP8P40818 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP8P40818 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP8P40818 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP8P40818 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP8P40818 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP8P40818 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP8P40818 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP8P40818 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
USP8P40818 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP8P40818 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
USP8P40818 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP8P40818 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
USP8P40818 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP8P40818 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
USP8P40818 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP8P40818 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms