Protein–RNA interactions for Protein: P38065

APL3, AP-2 complex subunit alpha, yeastyeast

Predictions only

Length 1,025 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
APL3P38065 YDR261W-BYDR261W-B 5313 nt2.78□□□□□ -1.96
APL3P38065 YFL002W-AYFL002W-A 5313 nt2.78□□□□□ -1.96
APL3P38065 YGR161W-BYGR161W-B 5313 nt2.78□□□□□ -1.96
APL3P38065 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt2.78□□□□□ -1.96
APL3P38065 YCL019WYCL019W 5313 nt2.78□□□□□ -1.96
APL3P38065 LEU3YLR451W 2661 nt2.78□□□□□ -1.96
APL3P38065 SKT5YBL061C 2091 nt2.78□□□□□ -1.96
APL3P38065 MET5YJR137C 4329 nt2.78□□□□□ -1.96
APL3P38065 FUS1YCL027W 1539 nt2.78□□□□□ -1.97
APL3P38065 GIS4YML006C 2325 nt2.77□□□□□ -1.97
APL3P38065 ROM1YGR070W 3468 nt2.77□□□□□ -1.97
APL3P38065 ECM25YJL201W 1800 nt2.77□□□□□ -1.97
APL3P38065 RRM3YHR031C 2172 nt2.77□□□□□ -1.97
APL3P38065 RPL40AYIL148W 387 nt2.77□□□□□ -1.97
APL3P38065 YLR458WYLR458W 381 nt2.77□□□□□ -1.97
APL3P38065 FLO1YAR050W 4614 nt2.77□□□□□ -1.97
APL3P38065 BNA4YBL098W 1383 nt2.76□□□□□ -1.97
APL3P38065 TFC1YBR123C 1950 nt2.76□□□□□ -1.97
APL3P38065 ATG13YPR185W 2217 nt2.76□□□□□ -1.97
APL3P38065 ADK1YDR226W 669 nt2.76□□□□□ -1.97
APL3P38065 DYN2YDR424C 279 nt2.76□□□□□ -1.97
APL3P38065 AST2YER101C 1293 nt2.76□□□□□ -1.97
APL3P38065 FCF2YLR051C 654 nt2.76□□□□□ -1.97
APL3P38065 RPS18BYML026C 441 nt2.76□□□□□ -1.97
APL3P38065 YAT2YER024W 2772 nt2.76□□□□□ -1.97
APL3P38065 NOT5YPR072W 1683 nt2.76□□□□□ -1.97
APL3P38065 NPR3YHL023C 3441 nt2.75□□□□□ -1.97
APL3P38065 GCD6YDR211W 2139 nt2.75□□□□□ -1.97
APL3P38065 IRC10YOL015W 1761 nt2.75□□□□□ -1.97
APL3P38065 SLH1YGR271W 5904 nt2.75□□□□□ -1.97
APL3P38065 snR79snR79 84 nt2.75□□□□□ -1.97
APL3P38065 DAD4YDR320C-A 219 nt2.75□□□□□ -1.97
APL3P38065 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt2.75□□□□□ -1.97
APL3P38065 CCW14YLR390W-A 717 nt2.75□□□□□ -1.97
APL3P38065 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt2.75□□□□□ -1.97
APL3P38065 YBR085C-AYBR085C-A 258 nt2.75□□□□□ -1.97
APL3P38065 PMR1YGL167C 2853 nt2.75□□□□□ -1.97
APL3P38065 KAP104YBR017C 2757 nt2.75□□□□□ -1.97
APL3P38065 RPA190YOR341W 4995 nt2.75□□□□□ -1.97
APL3P38065 RLF2YPR018W 1821 nt2.75□□□□□ -1.97
APL3P38065 INP52YNL106C 3552 nt2.74□□□□□ -1.97
APL3P38065 TFC4YGR047C 3078 nt2.74□□□□□ -1.97
APL3P38065 NAN1YPL126W 2691 nt2.74□□□□□ -1.97
APL3P38065 EXO84YBR102C 2262 nt2.74□□□□□ -1.97
APL3P38065 NOP4YPL043W 2058 nt2.74□□□□□ -1.97
APL3P38065 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt2.74□□□□□ -1.97
APL3P38065 YOR050CYOR050C 348 nt2.74□□□□□ -1.97
APL3P38065 YOR073W-AYOR073W-A 234 nt2.74□□□□□ -1.97
APL3P38065 snR42snR42 351 nt2.74□□□□□ -1.97
APL3P38065 MDM1YML104C 3384 nt2.74□□□□□ -1.97
APL3P38065 APC2YLR127C 2562 nt2.74□□□□□ -1.97
APL3P38065 RKM1YPL208W 1752 nt2.74□□□□□ -1.97
APL3P38065 YOL057WYOL057W 2136 nt2.74□□□□□ -1.97
APL3P38065 PRP8YHR165C 7242 nt2.74□□□□□ -1.97
APL3P38065 MSS11YMR164C 2277 nt2.73□□□□□ -1.97
APL3P38065 PSO2YMR137C 1986 nt2.73□□□□□ -1.97
APL3P38065 YER121WYER121W 345 nt2.73□□□□□ -1.97
APL3P38065 TRM7YBR061C 933 nt2.73□□□□□ -1.97
APL3P38065 MGR1YCL044C 1254 nt2.73□□□□□ -1.97
APL3P38065 DBP7YKR024C 2229 nt2.73□□□□□ -1.97
APL3P38065 ASG1YIL130W 2895 nt2.73□□□□□ -1.97
APL3P38065 TOM1YDR457W 9807 nt2.73□□□□□ -1.97
APL3P38065 SPG3YDR504C 384 nt2.72□□□□□ -1.97
APL3P38065 RPL14BYHL001W 417 nt2.72□□□□□ -1.97
APL3P38065 YMR324CYMR324C 243 nt2.72□□□□□ -1.97
APL3P38065 RPL25YOL127W 429 nt2.72□□□□□ -1.97
APL3P38065 SPB1YCL054W 2526 nt2.72□□□□□ -1.97
APL3P38065 NTO1YPR031W 2247 nt2.72□□□□□ -1.97
APL3P38065 VPS64YDR200C 1815 nt2.71□□□□□ -1.98
APL3P38065 LCL2YLR104W 396 nt2.71□□□□□ -1.98
APL3P38065 TMA10YLR327C 261 nt2.71□□□□□ -1.98
APL3P38065 YOR225WYOR225W 330 nt2.71□□□□□ -1.98
APL3P38065 SMC2YFR031C 3513 nt2.71□□□□□ -1.98
APL3P38065 TLC1TLC1 1301 nt2.7□□□□□ -1.98
APL3P38065 PRK1YIL095W 2433 nt2.7□□□□□ -1.98
APL3P38065 ITC1YGL133W 3795 nt2.7□□□□□ -1.98
APL3P38065 NMD2YHR077C 3270 nt2.7□□□□□ -1.98
APL3P38065 RPS24AYER074W 408 nt2.7□□□□□ -1.98
APL3P38065 RPL8BYLL045C 771 nt2.7□□□□□ -1.98
APL3P38065 HCH1YNL281W 462 nt2.7□□□□□ -1.98
APL3P38065 YPL182CYPL182C 384 nt2.7□□□□□ -1.98
APL3P38065 YPR146CYPR146C 330 nt2.7□□□□□ -1.98
APL3P38065 MOT1YPL082C 5604 nt2.7□□□□□ -1.98
APL3P38065 NUP120YKL057C 3114 nt2.7□□□□□ -1.98
APL3P38065 OSW7YFR039C 1533 nt2.69□□□□□ -1.98
APL3P38065 RPL35AYDL191W 363 nt2.69□□□□□ -1.98
APL3P38065 CSN9YDR179C 489 nt2.69□□□□□ -1.98
APL3P38065 YDR193WYDR193W 399 nt2.69□□□□□ -1.98
APL3P38065 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt2.69□□□□□ -1.98
APL3P38065 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt2.69□□□□□ -1.98
APL3P38065 RAM2YKL019W 951 nt2.69□□□□□ -1.98
APL3P38065 JLP2YMR132C 627 nt2.69□□□□□ -1.98
APL3P38065 YOP1YPR028W 543 nt2.69□□□□□ -1.98
APL3P38065 FUN30YAL019W 3396 nt2.69□□□□□ -1.98
APL3P38065 POM152YMR129W 4014 nt2.69□□□□□ -1.98
APL3P38065 PUF4YGL014W 2667 nt2.69□□□□□ -1.98
APL3P38065 VPS41YDR080W 2979 nt2.68□□□□□ -1.98
APL3P38065 VAS1YGR094W 3315 nt2.68□□□□□ -1.98
APL3P38065 MZM1YDR493W 372 nt2.68□□□□□ -1.98
APL3P38065 AYR1YIL124W 894 nt2.68□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 31.2 ms