Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNA1P35221 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNA1P35221 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms