Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DSG3P32926 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DSG3P32926 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DSG3P32926 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DSG3P32926 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
DSG3P32926 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DSG3P32926 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DSG3P32926 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DSG3P32926 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DSG3P32926 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DSG3P32926 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DSG3P32926 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DSG3P32926 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DSG3P32926 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DSG3P32926 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DSG3P32926 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DSG3P32926 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DSG3P32926 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DSG3P32926 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DSG3P32926 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DSG3P32926 LINC00226-202ENST00000618204 1052 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DSG3P32926 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DSG3P32926 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DSG3P32926 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DSG3P32926 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DSG3P32926 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DSG3P32926 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DSG3P32926 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DSG3P32926 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
DSG3P32926 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
DSG3P32926 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DSG3P32926 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DSG3P32926 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DSG3P32926 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DSG3P32926 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DSG3P32926 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DSG3P32926 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DSG3P32926 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DSG3P32926 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DSG3P32926 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DSG3P32926 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DSG3P32926 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DSG3P32926 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DSG3P32926 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DSG3P32926 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DSG3P32926 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DSG3P32926 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DSG3P32926 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
DSG3P32926 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DSG3P32926 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DSG3P32926 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DSG3P32926 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DSG3P32926 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DSG3P32926 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DSG3P32926 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DSG3P32926 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DSG3P32926 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DSG3P32926 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DSG3P32926 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DSG3P32926 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DSG3P32926 ETFRF1-205ENST00000555711 783 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DSG3P32926 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DSG3P32926 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DSG3P32926 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DSG3P32926 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DSG3P32926 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
DSG3P32926 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DSG3P32926 AC010326.4-201ENST00000604665 891 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
DSG3P32926 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DSG3P32926 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DSG3P32926 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DSG3P32926 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DSG3P32926 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DSG3P32926 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DSG3P32926 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DSG3P32926 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DSG3P32926 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DSG3P32926 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DSG3P32926 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DSG3P32926 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DSG3P32926 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DSG3P32926 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DSG3P32926 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DSG3P32926 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DSG3P32926 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DSG3P32926 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DSG3P32926 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DSG3P32926 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DSG3P32926 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DSG3P32926 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DSG3P32926 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
DSG3P32926 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DSG3P32926 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DSG3P32926 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DSG3P32926 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DSG3P32926 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DSG3P32926 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DSG3P32926 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DSG3P32926 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DSG3P32926 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms