Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
OTX2P32243 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
OTX2P32243 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
OTX2P32243 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
OTX2P32243 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
OTX2P32243 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
OTX2P32243 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
OTX2P32243 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
OTX2P32243 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
OTX2P32243 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
OTX2P32243 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
OTX2P32243 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
OTX2P32243 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
OTX2P32243 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
OTX2P32243 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
OTX2P32243 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
OTX2P32243 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
OTX2P32243 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
OTX2P32243 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
OTX2P32243 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
OTX2P32243 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
OTX2P32243 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
OTX2P32243 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
OTX2P32243 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
OTX2P32243 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
OTX2P32243 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
OTX2P32243 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
OTX2P32243 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
OTX2P32243 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
OTX2P32243 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
OTX2P32243 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
OTX2P32243 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
OTX2P32243 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
OTX2P32243 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
OTX2P32243 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
OTX2P32243 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
OTX2P32243 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
OTX2P32243 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
OTX2P32243 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
OTX2P32243 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
OTX2P32243 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
OTX2P32243 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
OTX2P32243 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
OTX2P32243 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
OTX2P32243 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
OTX2P32243 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
OTX2P32243 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
OTX2P32243 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
OTX2P32243 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
OTX2P32243 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
OTX2P32243 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
OTX2P32243 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
OTX2P32243 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
OTX2P32243 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
OTX2P32243 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
OTX2P32243 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
OTX2P32243 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
OTX2P32243 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
OTX2P32243 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
OTX2P32243 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
OTX2P32243 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
OTX2P32243 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
OTX2P32243 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
OTX2P32243 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
OTX2P32243 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
OTX2P32243 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
OTX2P32243 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
OTX2P32243 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
OTX2P32243 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
OTX2P32243 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
OTX2P32243 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
OTX2P32243 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
OTX2P32243 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
OTX2P32243 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
OTX2P32243 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
OTX2P32243 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
OTX2P32243 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
OTX2P32243 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
OTX2P32243 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
OTX2P32243 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
OTX2P32243 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
OTX2P32243 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
OTX2P32243 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
OTX2P32243 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
OTX2P32243 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
OTX2P32243 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
OTX2P32243 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
OTX2P32243 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
OTX2P32243 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
OTX2P32243 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
OTX2P32243 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
OTX2P32243 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
OTX2P32243 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
OTX2P32243 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
OTX2P32243 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
OTX2P32243 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
OTX2P32243 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
OTX2P32243 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
OTX2P32243 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
OTX2P32243 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms