Protein–RNA interactions for Protein: P32242

OTX1, Homeobox protein OTX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX1P32242 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OTX1P32242 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OTX1P32242 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
OTX1P32242 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OTX1P32242 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
OTX1P32242 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
OTX1P32242 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
OTX1P32242 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OTX1P32242 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OTX1P32242 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OTX1P32242 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OTX1P32242 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
OTX1P32242 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OTX1P32242 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OTX1P32242 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OTX1P32242 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OTX1P32242 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OTX1P32242 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OTX1P32242 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OTX1P32242 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
OTX1P32242 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
OTX1P32242 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
OTX1P32242 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
OTX1P32242 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
OTX1P32242 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
OTX1P32242 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
OTX1P32242 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
OTX1P32242 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
OTX1P32242 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
OTX1P32242 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
OTX1P32242 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
OTX1P32242 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
OTX1P32242 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
OTX1P32242 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
OTX1P32242 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
OTX1P32242 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
OTX1P32242 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
OTX1P32242 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
OTX1P32242 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
OTX1P32242 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
OTX1P32242 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
OTX1P32242 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
OTX1P32242 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
OTX1P32242 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
OTX1P32242 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
OTX1P32242 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
OTX1P32242 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
OTX1P32242 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
OTX1P32242 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
OTX1P32242 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
OTX1P32242 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
OTX1P32242 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
OTX1P32242 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
OTX1P32242 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
OTX1P32242 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
OTX1P32242 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
OTX1P32242 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
OTX1P32242 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
OTX1P32242 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
OTX1P32242 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
OTX1P32242 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
OTX1P32242 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
OTX1P32242 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
OTX1P32242 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
OTX1P32242 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
OTX1P32242 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
OTX1P32242 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
OTX1P32242 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
OTX1P32242 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
OTX1P32242 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
OTX1P32242 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTX1P32242 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTX1P32242 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTX1P32242 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTX1P32242 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTX1P32242 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTX1P32242 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
OTX1P32242 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
OTX1P32242 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTX1P32242 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTX1P32242 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTX1P32242 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTX1P32242 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
OTX1P32242 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTX1P32242 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTX1P32242 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTX1P32242 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTX1P32242 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTX1P32242 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTX1P32242 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTX1P32242 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTX1P32242 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
OTX1P32242 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTX1P32242 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTX1P32242 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTX1P32242 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTX1P32242 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
OTX1P32242 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
OTX1P32242 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
OTX1P32242 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms