Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXC13P31276 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms