Protein–RNA interactions for Protein: P30281

CCND3, G1/S-specific cyclin-D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND3P30281 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCND3P30281 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCND3P30281 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCND3P30281 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCND3P30281 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCND3P30281 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCND3P30281 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCND3P30281 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCND3P30281 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCND3P30281 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCND3P30281 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCND3P30281 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCND3P30281 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCND3P30281 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCND3P30281 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCND3P30281 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCND3P30281 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCND3P30281 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCND3P30281 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCND3P30281 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCND3P30281 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCND3P30281 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCND3P30281 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCND3P30281 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCND3P30281 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCND3P30281 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCND3P30281 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCND3P30281 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCND3P30281 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCND3P30281 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCND3P30281 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCND3P30281 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCND3P30281 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCND3P30281 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCND3P30281 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCND3P30281 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCND3P30281 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCND3P30281 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCND3P30281 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCND3P30281 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCND3P30281 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCND3P30281 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCND3P30281 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCND3P30281 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCND3P30281 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCND3P30281 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCND3P30281 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCND3P30281 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCND3P30281 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCND3P30281 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCND3P30281 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCND3P30281 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCND3P30281 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCND3P30281 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCND3P30281 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCND3P30281 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCND3P30281 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCND3P30281 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCND3P30281 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCND3P30281 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCND3P30281 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCND3P30281 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCND3P30281 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCND3P30281 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCND3P30281 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCND3P30281 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCND3P30281 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCND3P30281 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCND3P30281 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCND3P30281 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCND3P30281 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCND3P30281 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCND3P30281 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCND3P30281 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCND3P30281 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCND3P30281 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCND3P30281 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCND3P30281 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCND3P30281 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCND3P30281 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCND3P30281 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCND3P30281 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCND3P30281 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCND3P30281 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCND3P30281 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCND3P30281 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCND3P30281 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCND3P30281 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCND3P30281 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCND3P30281 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCND3P30281 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCND3P30281 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCND3P30281 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCND3P30281 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCND3P30281 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCND3P30281 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCND3P30281 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCND3P30281 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCND3P30281 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCND3P30281 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms