Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDC27P30260 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDC27P30260 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC27P30260 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC27P30260 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC27P30260 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC27P30260 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC27P30260 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC27P30260 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC27P30260 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC27P30260 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC27P30260 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC27P30260 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC27P30260 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC27P30260 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC27P30260 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC27P30260 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC27P30260 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC27P30260 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC27P30260 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC27P30260 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC27P30260 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC27P30260 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC27P30260 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC27P30260 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC27P30260 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC27P30260 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC27P30260 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC27P30260 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC27P30260 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC27P30260 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC27P30260 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC27P30260 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC27P30260 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC27P30260 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC27P30260 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC27P30260 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC27P30260 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC27P30260 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC27P30260 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC27P30260 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC27P30260 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC27P30260 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC27P30260 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC27P30260 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC27P30260 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC27P30260 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC27P30260 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDC27P30260 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDC27P30260 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDC27P30260 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDC27P30260 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDC27P30260 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDC27P30260 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDC27P30260 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDC27P30260 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDC27P30260 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDC27P30260 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDC27P30260 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDC27P30260 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDC27P30260 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CDC27P30260 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDC27P30260 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDC27P30260 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDC27P30260 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDC27P30260 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDC27P30260 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDC27P30260 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDC27P30260 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDC27P30260 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDC27P30260 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDC27P30260 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CDC27P30260 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDC27P30260 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CDC27P30260 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDC27P30260 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CDC27P30260 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CDC27P30260 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDC27P30260 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDC27P30260 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDC27P30260 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDC27P30260 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDC27P30260 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CDC27P30260 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDC27P30260 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDC27P30260 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDC27P30260 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDC27P30260 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDC27P30260 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CDC27P30260 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDC27P30260 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CDC27P30260 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CDC27P30260 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDC27P30260 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CDC27P30260 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDC27P30260 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDC27P30260 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDC27P30260 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDC27P30260 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDC27P30260 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms