Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARID4AP29374 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ARID4AP29374 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms