Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP1P28562 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms