Protein–RNA interactions for Protein: P28069

POU1F1, Pituitary-specific positive transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU1F1P28069 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
POU1F1P28069 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POU1F1P28069 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POU1F1P28069 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms