Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR2AP24928 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR2AP24928 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR2AP24928 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR2AP24928 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR2AP24928 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR2AP24928 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR2AP24928 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR2AP24928 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR2AP24928 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR2AP24928 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR2AP24928 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR2AP24928 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR2AP24928 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR2AP24928 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR2AP24928 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR2AP24928 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR2AP24928 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR2AP24928 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR2AP24928 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR2AP24928 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR2AP24928 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR2AP24928 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR2AP24928 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR2AP24928 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR2AP24928 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR2AP24928 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR2AP24928 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR2AP24928 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR2AP24928 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms