Protein–RNA interactions for Protein: P24864

CCNE1, G1/S-specific cyclin-E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1P24864 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNE1P24864 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNE1P24864 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms