Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATP5F1P24539 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP5F1P24539 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP5F1P24539 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP5F1P24539 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP5F1P24539 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP5F1P24539 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP5F1P24539 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP5F1P24539 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP5F1P24539 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP5F1P24539 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP5F1P24539 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP5F1P24539 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP5F1P24539 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP5F1P24539 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP5F1P24539 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP5F1P24539 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP5F1P24539 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP5F1P24539 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP5F1P24539 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP5F1P24539 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP5F1P24539 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP5F1P24539 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP5F1P24539 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP5F1P24539 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP5F1P24539 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP5F1P24539 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP5F1P24539 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP5F1P24539 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP5F1P24539 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATP5F1P24539 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATP5F1P24539 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATP5F1P24539 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5F1P24539 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5F1P24539 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5F1P24539 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5F1P24539 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5F1P24539 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5F1P24539 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5F1P24539 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5F1P24539 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5F1P24539 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5F1P24539 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5F1P24539 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5F1P24539 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5F1P24539 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5F1P24539 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5F1P24539 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5F1P24539 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5F1P24539 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5F1P24539 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5F1P24539 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5F1P24539 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5F1P24539 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5F1P24539 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5F1P24539 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5F1P24539 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5F1P24539 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5F1P24539 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5F1P24539 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5F1P24539 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5F1P24539 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ATP5F1P24539 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ATP5F1P24539 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5F1P24539 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5F1P24539 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5F1P24539 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5F1P24539 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5F1P24539 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5F1P24539 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP5F1P24539 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP5F1P24539 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP5F1P24539 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP5F1P24539 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP5F1P24539 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP5F1P24539 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP5F1P24539 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP5F1P24539 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP5F1P24539 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP5F1P24539 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP5F1P24539 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP5F1P24539 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP5F1P24539 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP5F1P24539 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP5F1P24539 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP5F1P24539 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP5F1P24539 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP5F1P24539 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP5F1P24539 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP5F1P24539 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP5F1P24539 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP5F1P24539 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP5F1P24539 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP5F1P24539 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP5F1P24539 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP5F1P24539 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP5F1P24539 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP5F1P24539 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP5F1P24539 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP5F1P24539 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms