Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms