Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FGFR4P22455 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FGFR4P22455 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms