Protein–RNA interactions for Protein: P20851

C4BPB, C4b-binding protein beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BPBP20851 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C4BPBP20851 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C4BPBP20851 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C4BPBP20851 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C4BPBP20851 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C4BPBP20851 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C4BPBP20851 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C4BPBP20851 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C4BPBP20851 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C4BPBP20851 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C4BPBP20851 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C4BPBP20851 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C4BPBP20851 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C4BPBP20851 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C4BPBP20851 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
C4BPBP20851 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
C4BPBP20851 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C4BPBP20851 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C4BPBP20851 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C4BPBP20851 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C4BPBP20851 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C4BPBP20851 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C4BPBP20851 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C4BPBP20851 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C4BPBP20851 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C4BPBP20851 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C4BPBP20851 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C4BPBP20851 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C4BPBP20851 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C4BPBP20851 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
C4BPBP20851 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C4BPBP20851 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C4BPBP20851 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C4BPBP20851 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C4BPBP20851 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C4BPBP20851 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C4BPBP20851 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C4BPBP20851 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C4BPBP20851 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
C4BPBP20851 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C4BPBP20851 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C4BPBP20851 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C4BPBP20851 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C4BPBP20851 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C4BPBP20851 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C4BPBP20851 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C4BPBP20851 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C4BPBP20851 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C4BPBP20851 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C4BPBP20851 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C4BPBP20851 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C4BPBP20851 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C4BPBP20851 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C4BPBP20851 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C4BPBP20851 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C4BPBP20851 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C4BPBP20851 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C4BPBP20851 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C4BPBP20851 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C4BPBP20851 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C4BPBP20851 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C4BPBP20851 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C4BPBP20851 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C4BPBP20851 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C4BPBP20851 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C4BPBP20851 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
C4BPBP20851 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C4BPBP20851 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C4BPBP20851 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
C4BPBP20851 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
C4BPBP20851 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
C4BPBP20851 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
C4BPBP20851 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
C4BPBP20851 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
C4BPBP20851 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
C4BPBP20851 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
C4BPBP20851 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
C4BPBP20851 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
C4BPBP20851 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C4BPBP20851 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C4BPBP20851 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C4BPBP20851 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C4BPBP20851 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C4BPBP20851 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C4BPBP20851 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C4BPBP20851 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C4BPBP20851 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C4BPBP20851 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C4BPBP20851 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
C4BPBP20851 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C4BPBP20851 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C4BPBP20851 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C4BPBP20851 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
C4BPBP20851 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C4BPBP20851 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C4BPBP20851 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C4BPBP20851 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C4BPBP20851 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
C4BPBP20851 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
C4BPBP20851 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms