Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP4AP20648 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP4AP20648 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP4AP20648 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP4AP20648 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP4AP20648 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP4AP20648 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP4AP20648 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP4AP20648 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP4AP20648 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP4AP20648 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP4AP20648 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP4AP20648 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP4AP20648 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP4AP20648 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP4AP20648 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP4AP20648 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP4AP20648 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP4AP20648 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP4AP20648 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP4AP20648 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP4AP20648 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP4AP20648 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP4AP20648 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP4AP20648 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP4AP20648 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP4AP20648 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP4AP20648 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP4AP20648 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP4AP20648 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP4AP20648 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP4AP20648 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP4AP20648 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP4AP20648 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP4AP20648 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP4AP20648 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP4AP20648 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP4AP20648 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP4AP20648 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP4AP20648 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP4AP20648 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP4AP20648 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP4AP20648 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP4AP20648 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP4AP20648 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP4AP20648 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP4AP20648 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP4AP20648 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP4AP20648 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP4AP20648 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP4AP20648 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP4AP20648 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP4AP20648 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP4AP20648 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP4AP20648 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP4AP20648 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP4AP20648 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP4AP20648 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP4AP20648 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP4AP20648 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP4AP20648 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP4AP20648 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP4AP20648 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATP4AP20648 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms