Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB4AP20338 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB4AP20338 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms