Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRIM21P19474 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM21P19474 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms