Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCLP19338 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCLP19338 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCLP19338 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCLP19338 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCLP19338 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCLP19338 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCLP19338 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCLP19338 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCLP19338 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCLP19338 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCLP19338 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCLP19338 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCLP19338 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCLP19338 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCLP19338 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCLP19338 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCLP19338 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCLP19338 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCLP19338 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCLP19338 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCLP19338 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCLP19338 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCLP19338 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCLP19338 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NCLP19338 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCLP19338 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCLP19338 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCLP19338 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCLP19338 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCLP19338 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCLP19338 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCLP19338 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCLP19338 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCLP19338 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCLP19338 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCLP19338 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCLP19338 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCLP19338 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCLP19338 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCLP19338 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCLP19338 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCLP19338 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCLP19338 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCLP19338 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCLP19338 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCLP19338 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCLP19338 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCLP19338 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCLP19338 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCLP19338 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NCLP19338 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NCLP19338 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCLP19338 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCLP19338 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCLP19338 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCLP19338 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCLP19338 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCLP19338 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCLP19338 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCLP19338 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCLP19338 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCLP19338 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCLP19338 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCLP19338 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCLP19338 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCLP19338 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCLP19338 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCLP19338 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCLP19338 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCLP19338 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCLP19338 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCLP19338 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCLP19338 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCLP19338 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCLP19338 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCLP19338 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCLP19338 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCLP19338 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCLP19338 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCLP19338 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCLP19338 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCLP19338 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCLP19338 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NCLP19338 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCLP19338 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCLP19338 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCLP19338 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCLP19338 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCLP19338 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCLP19338 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCLP19338 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCLP19338 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCLP19338 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCLP19338 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCLP19338 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCLP19338 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCLP19338 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCLP19338 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCLP19338 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms