Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EGR1P18146 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EGR1P18146 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EGR1P18146 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EGR1P18146 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EGR1P18146 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EGR1P18146 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
EGR1P18146 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EGR1P18146 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EGR1P18146 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EGR1P18146 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EGR1P18146 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EGR1P18146 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EGR1P18146 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EGR1P18146 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EGR1P18146 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EGR1P18146 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EGR1P18146 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EGR1P18146 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EGR1P18146 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EGR1P18146 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EGR1P18146 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EGR1P18146 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EGR1P18146 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EGR1P18146 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EGR1P18146 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EGR1P18146 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EGR1P18146 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EGR1P18146 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EGR1P18146 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
EGR1P18146 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EGR1P18146 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EGR1P18146 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
EGR1P18146 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EGR1P18146 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EGR1P18146 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
EGR1P18146 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EGR1P18146 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EGR1P18146 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EGR1P18146 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EGR1P18146 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EGR1P18146 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EGR1P18146 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EGR1P18146 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EGR1P18146 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EGR1P18146 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EGR1P18146 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EGR1P18146 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EGR1P18146 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EGR1P18146 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EGR1P18146 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EGR1P18146 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EGR1P18146 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EGR1P18146 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EGR1P18146 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EGR1P18146 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EGR1P18146 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EGR1P18146 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EGR1P18146 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EGR1P18146 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EGR1P18146 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
EGR1P18146 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
EGR1P18146 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EGR1P18146 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EGR1P18146 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EGR1P18146 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EGR1P18146 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EGR1P18146 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
EGR1P18146 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EGR1P18146 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EGR1P18146 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EGR1P18146 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EGR1P18146 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EGR1P18146 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
EGR1P18146 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EGR1P18146 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EGR1P18146 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EGR1P18146 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EGR1P18146 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EGR1P18146 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EGR1P18146 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EGR1P18146 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EGR1P18146 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EGR1P18146 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EGR1P18146 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EGR1P18146 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EGR1P18146 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EGR1P18146 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EGR1P18146 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EGR1P18146 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EGR1P18146 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EGR1P18146 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EGR1P18146 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EGR1P18146 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EGR1P18146 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EGR1P18146 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EGR1P18146 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EGR1P18146 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EGR1P18146 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EGR1P18146 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms