Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPI1P17947 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPI1P17947 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPI1P17947 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPI1P17947 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPI1P17947 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPI1P17947 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPI1P17947 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPI1P17947 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPI1P17947 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPI1P17947 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPI1P17947 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPI1P17947 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPI1P17947 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPI1P17947 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPI1P17947 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPI1P17947 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPI1P17947 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPI1P17947 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPI1P17947 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPI1P17947 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPI1P17947 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPI1P17947 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPI1P17947 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPI1P17947 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPI1P17947 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPI1P17947 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPI1P17947 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPI1P17947 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPI1P17947 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPI1P17947 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPI1P17947 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPI1P17947 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPI1P17947 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPI1P17947 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPI1P17947 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPI1P17947 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPI1P17947 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPI1P17947 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPI1P17947 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPI1P17947 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPI1P17947 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPI1P17947 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPI1P17947 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPI1P17947 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPI1P17947 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPI1P17947 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPI1P17947 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPI1P17947 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPI1P17947 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPI1P17947 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPI1P17947 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPI1P17947 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPI1P17947 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SPI1P17947 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPI1P17947 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPI1P17947 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SPI1P17947 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPI1P17947 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPI1P17947 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPI1P17947 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPI1P17947 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPI1P17947 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPI1P17947 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPI1P17947 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPI1P17947 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPI1P17947 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPI1P17947 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPI1P17947 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPI1P17947 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SPI1P17947 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPI1P17947 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPI1P17947 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPI1P17947 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPI1P17947 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPI1P17947 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SPI1P17947 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPI1P17947 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPI1P17947 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPI1P17947 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPI1P17947 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPI1P17947 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPI1P17947 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPI1P17947 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPI1P17947 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPI1P17947 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPI1P17947 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPI1P17947 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SPI1P17947 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPI1P17947 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPI1P17947 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPI1P17947 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPI1P17947 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPI1P17947 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPI1P17947 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPI1P17947 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPI1P17947 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPI1P17947 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPI1P17947 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPI1P17947 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms