Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCL3L1P16619 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCL3L1P16619 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCL3L1P16619 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCL3L1P16619 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCL3L1P16619 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCL3L1P16619 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCL3L1P16619 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CCL3L1P16619 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CCL3L1P16619 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CCL3L1P16619 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCL3L1P16619 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCL3L1P16619 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCL3L1P16619 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCL3L1P16619 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCL3L1P16619 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CCL3L1P16619 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCL3L1P16619 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCL3L1P16619 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCL3L1P16619 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CCL3L1P16619 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCL3L1P16619 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCL3L1P16619 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCL3L1P16619 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCL3L1P16619 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCL3L1P16619 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCL3L1P16619 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCL3L1P16619 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCL3L1P16619 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCL3L1P16619 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCL3L1P16619 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCL3L1P16619 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCL3L1P16619 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCL3L1P16619 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCL3L1P16619 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CCL3L1P16619 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCL3L1P16619 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCL3L1P16619 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CCL3L1P16619 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCL3L1P16619 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCL3L1P16619 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCL3L1P16619 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCL3L1P16619 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCL3L1P16619 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCL3L1P16619 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCL3L1P16619 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCL3L1P16619 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCL3L1P16619 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCL3L1P16619 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCL3L1P16619 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCL3L1P16619 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCL3L1P16619 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCL3L1P16619 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCL3L1P16619 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCL3L1P16619 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCL3L1P16619 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCL3L1P16619 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCL3L1P16619 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCL3L1P16619 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCL3L1P16619 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CCL3L1P16619 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCL3L1P16619 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CCL3L1P16619 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCL3L1P16619 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCL3L1P16619 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCL3L1P16619 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCL3L1P16619 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCL3L1P16619 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCL3L1P16619 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCL3L1P16619 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCL3L1P16619 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCL3L1P16619 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCL3L1P16619 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCL3L1P16619 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCL3L1P16619 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCL3L1P16619 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCL3L1P16619 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCL3L1P16619 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCL3L1P16619 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCL3L1P16619 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCL3L1P16619 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCL3L1P16619 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCL3L1P16619 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCL3L1P16619 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCL3L1P16619 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCL3L1P16619 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCL3L1P16619 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCL3L1P16619 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCL3L1P16619 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCL3L1P16619 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CCL3L1P16619 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CCL3L1P16619 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CCL3L1P16619 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCL3L1P16619 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCL3L1P16619 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCL3L1P16619 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCL3L1P16619 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCL3L1P16619 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCL3L1P16619 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCL3L1P16619 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms