Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2A2P16615 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2A2P16615 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms