Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRF1P14222 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRF1P14222 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRF1P14222 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRF1P14222 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRF1P14222 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRF1P14222 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRF1P14222 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRF1P14222 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PRF1P14222 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRF1P14222 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRF1P14222 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRF1P14222 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRF1P14222 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRF1P14222 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRF1P14222 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRF1P14222 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRF1P14222 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRF1P14222 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRF1P14222 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRF1P14222 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRF1P14222 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PRF1P14222 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PRF1P14222 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PRF1P14222 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRF1P14222 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRF1P14222 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRF1P14222 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRF1P14222 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRF1P14222 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRF1P14222 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRF1P14222 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PRF1P14222 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRF1P14222 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRF1P14222 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRF1P14222 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRF1P14222 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRF1P14222 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRF1P14222 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRF1P14222 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRF1P14222 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRF1P14222 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRF1P14222 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRF1P14222 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRF1P14222 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRF1P14222 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRF1P14222 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRF1P14222 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRF1P14222 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRF1P14222 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRF1P14222 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRF1P14222 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRF1P14222 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRF1P14222 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRF1P14222 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRF1P14222 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRF1P14222 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRF1P14222 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRF1P14222 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRF1P14222 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRF1P14222 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRF1P14222 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRF1P14222 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PRF1P14222 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PRF1P14222 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRF1P14222 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRF1P14222 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRF1P14222 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRF1P14222 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRF1P14222 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRF1P14222 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRF1P14222 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRF1P14222 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRF1P14222 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PRF1P14222 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRF1P14222 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRF1P14222 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRF1P14222 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRF1P14222 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRF1P14222 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRF1P14222 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRF1P14222 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRF1P14222 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRF1P14222 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRF1P14222 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRF1P14222 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRF1P14222 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRF1P14222 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRF1P14222 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRF1P14222 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRF1P14222 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRF1P14222 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRF1P14222 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRF1P14222 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRF1P14222 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRF1P14222 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRF1P14222 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRF1P14222 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRF1P14222 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRF1P14222 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms