Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC5A1P13866 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms