Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BMP3P12645 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BMP3P12645 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BMP3P12645 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BMP3P12645 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BMP3P12645 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
BMP3P12645 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BMP3P12645 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BMP3P12645 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BMP3P12645 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BMP3P12645 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BMP3P12645 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BMP3P12645 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BMP3P12645 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BMP3P12645 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BMP3P12645 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BMP3P12645 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BMP3P12645 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BMP3P12645 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BMP3P12645 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
BMP3P12645 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BMP3P12645 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BMP3P12645 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BMP3P12645 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BMP3P12645 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BMP3P12645 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
BMP3P12645 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BMP3P12645 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BMP3P12645 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BMP3P12645 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BMP3P12645 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BMP3P12645 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BMP3P12645 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BMP3P12645 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BMP3P12645 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BMP3P12645 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BMP3P12645 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BMP3P12645 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
BMP3P12645 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BMP3P12645 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BMP3P12645 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BMP3P12645 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BMP3P12645 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BMP3P12645 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BMP3P12645 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BMP3P12645 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BMP3P12645 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BMP3P12645 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BMP3P12645 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BMP3P12645 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
BMP3P12645 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BMP3P12645 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BMP3P12645 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BMP3P12645 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BMP3P12645 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BMP3P12645 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BMP3P12645 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BMP3P12645 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BMP3P12645 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BMP3P12645 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BMP3P12645 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
BMP3P12645 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BMP3P12645 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BMP3P12645 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BMP3P12645 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BMP3P12645 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BMP3P12645 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BMP3P12645 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BMP3P12645 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BMP3P12645 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BMP3P12645 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BMP3P12645 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BMP3P12645 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BMP3P12645 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BMP3P12645 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BMP3P12645 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BMP3P12645 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BMP3P12645 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BMP3P12645 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BMP3P12645 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BMP3P12645 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
BMP3P12645 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BMP3P12645 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BMP3P12645 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BMP3P12645 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BMP3P12645 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BMP3P12645 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BMP3P12645 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
BMP3P12645 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BMP3P12645 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BMP3P12645 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BMP3P12645 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BMP3P12645 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BMP3P12645 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BMP3P12645 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BMP3P12645 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BMP3P12645 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BMP3P12645 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BMP3P12645 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BMP3P12645 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms