Protein–RNA interactions for Protein: P12277

CKB, Creatine kinase B-type, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKBP12277 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CKBP12277 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CKBP12277 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CKBP12277 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CKBP12277 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CKBP12277 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CKBP12277 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CKBP12277 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CKBP12277 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CKBP12277 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CKBP12277 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CKBP12277 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CKBP12277 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CKBP12277 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CKBP12277 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CKBP12277 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CKBP12277 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CKBP12277 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CKBP12277 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CKBP12277 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CKBP12277 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CKBP12277 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CKBP12277 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CKBP12277 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CKBP12277 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CKBP12277 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CKBP12277 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CKBP12277 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CKBP12277 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CKBP12277 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CKBP12277 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CKBP12277 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKBP12277 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKBP12277 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKBP12277 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKBP12277 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKBP12277 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKBP12277 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKBP12277 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKBP12277 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKBP12277 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKBP12277 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKBP12277 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKBP12277 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CKBP12277 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKBP12277 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKBP12277 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKBP12277 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKBP12277 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CKBP12277 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CKBP12277 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CKBP12277 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CKBP12277 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CKBP12277 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CKBP12277 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CKBP12277 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CKBP12277 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CKBP12277 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CKBP12277 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CKBP12277 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CKBP12277 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CKBP12277 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CKBP12277 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CKBP12277 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKBP12277 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKBP12277 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKBP12277 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKBP12277 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKBP12277 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKBP12277 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKBP12277 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKBP12277 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CKBP12277 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKBP12277 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CKBP12277 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKBP12277 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKBP12277 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CKBP12277 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKBP12277 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CKBP12277 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CKBP12277 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CKBP12277 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CKBP12277 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CKBP12277 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CKBP12277 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CKBP12277 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CKBP12277 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CKBP12277 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CKBP12277 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CKBP12277 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CKBP12277 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CKBP12277 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CKBP12277 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CKBP12277 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CKBP12277 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CKBP12277 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CKBP12277 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CKBP12277 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CKBP12277 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CKBP12277 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms