Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
TOP2AP11388 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
TOP2AP11388 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
TOP2AP11388 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
TOP2AP11388 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
TOP2AP11388 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
TOP2AP11388 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
TOP2AP11388 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
TOP2AP11388 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
TOP2AP11388 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
TOP2AP11388 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
TOP2AP11388 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
TOP2AP11388 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
TOP2AP11388 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
TOP2AP11388 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
TOP2AP11388 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
TOP2AP11388 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
TOP2AP11388 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
TOP2AP11388 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
TOP2AP11388 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
TOP2AP11388 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
TOP2AP11388 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
TOP2AP11388 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
TOP2AP11388 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
TOP2AP11388 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
TOP2AP11388 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
TOP2AP11388 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
TOP2AP11388 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
TOP2AP11388 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC36.1■■■■□ 3.37
TOP2AP11388 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
TOP2AP11388 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
TOP2AP11388 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
TOP2AP11388 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
TOP2AP11388 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
TOP2AP11388 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
TOP2AP11388 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
TOP2AP11388 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
TOP2AP11388 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
TOP2AP11388 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC36.09■■■■□ 3.37
TOP2AP11388 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
TOP2AP11388 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
TOP2AP11388 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
TOP2AP11388 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
TOP2AP11388 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
TOP2AP11388 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
TOP2AP11388 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
TOP2AP11388 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
TOP2AP11388 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC36.08■■■■□ 3.37
TOP2AP11388 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
TOP2AP11388 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC36.08■■■■□ 3.37
TOP2AP11388 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
TOP2AP11388 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
TOP2AP11388 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
TOP2AP11388 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
TOP2AP11388 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
TOP2AP11388 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
TOP2AP11388 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
TOP2AP11388 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
TOP2AP11388 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
TOP2AP11388 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
TOP2AP11388 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
TOP2AP11388 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
TOP2AP11388 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
TOP2AP11388 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
TOP2AP11388 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
TOP2AP11388 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
TOP2AP11388 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
TOP2AP11388 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
TOP2AP11388 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
TOP2AP11388 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
TOP2AP11388 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
TOP2AP11388 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
TOP2AP11388 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC36.05■■■■□ 3.36
TOP2AP11388 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
TOP2AP11388 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
TOP2AP11388 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
TOP2AP11388 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
TOP2AP11388 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
TOP2AP11388 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
TOP2AP11388 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
TOP2AP11388 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
TOP2AP11388 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
TOP2AP11388 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC36.04■■■■□ 3.36
TOP2AP11388 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
TOP2AP11388 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
TOP2AP11388 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
TOP2AP11388 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
TOP2AP11388 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
TOP2AP11388 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
TOP2AP11388 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
TOP2AP11388 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
TOP2AP11388 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
TOP2AP11388 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
TOP2AP11388 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
TOP2AP11388 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
TOP2AP11388 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
TOP2AP11388 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
TOP2AP11388 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
TOP2AP11388 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
TOP2AP11388 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms