Protein–RNA interactions for Protein: P10747

CD28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD28P10747 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD28P10747 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CD28P10747 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD28P10747 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD28P10747 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD28P10747 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD28P10747 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD28P10747 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD28P10747 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD28P10747 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD28P10747 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD28P10747 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD28P10747 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD28P10747 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD28P10747 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CD28P10747 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD28P10747 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD28P10747 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD28P10747 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD28P10747 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD28P10747 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD28P10747 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD28P10747 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD28P10747 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD28P10747 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD28P10747 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD28P10747 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD28P10747 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD28P10747 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD28P10747 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD28P10747 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD28P10747 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD28P10747 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD28P10747 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD28P10747 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD28P10747 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD28P10747 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD28P10747 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD28P10747 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD28P10747 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD28P10747 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD28P10747 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD28P10747 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CD28P10747 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD28P10747 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD28P10747 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CD28P10747 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CD28P10747 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CD28P10747 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD28P10747 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD28P10747 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD28P10747 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD28P10747 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD28P10747 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD28P10747 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD28P10747 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD28P10747 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD28P10747 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD28P10747 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD28P10747 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD28P10747 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD28P10747 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD28P10747 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CD28P10747 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD28P10747 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CD28P10747 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD28P10747 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CD28P10747 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD28P10747 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD28P10747 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CD28P10747 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD28P10747 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD28P10747 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD28P10747 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD28P10747 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD28P10747 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD28P10747 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD28P10747 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD28P10747 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD28P10747 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD28P10747 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD28P10747 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD28P10747 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD28P10747 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CD28P10747 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD28P10747 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD28P10747 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CD28P10747 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD28P10747 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CD28P10747 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD28P10747 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD28P10747 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD28P10747 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD28P10747 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD28P10747 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD28P10747 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD28P10747 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD28P10747 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD28P10747 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CD28P10747 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms