Protein–RNA interactions for Protein: P0DP91

CSB-PGBD3, Chimeric ERCC6-PGBD3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,061 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSB-PGBD3P0DP91 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CSB-PGBD3P0DP91 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CSB-PGBD3P0DP91 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CSB-PGBD3P0DP91 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CSB-PGBD3P0DP91 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CSB-PGBD3P0DP91 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CSB-PGBD3P0DP91 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CSB-PGBD3P0DP91 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CSB-PGBD3P0DP91 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CSB-PGBD3P0DP91 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CSB-PGBD3P0DP91 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CSB-PGBD3P0DP91 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CSB-PGBD3P0DP91 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CSB-PGBD3P0DP91 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CSB-PGBD3P0DP91 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CSB-PGBD3P0DP91 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CSB-PGBD3P0DP91 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CSB-PGBD3P0DP91 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CSB-PGBD3P0DP91 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CSB-PGBD3P0DP91 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CSB-PGBD3P0DP91 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CSB-PGBD3P0DP91 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CSB-PGBD3P0DP91 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CSB-PGBD3P0DP91 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CSB-PGBD3P0DP91 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CSB-PGBD3P0DP91 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CSB-PGBD3P0DP91 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CSB-PGBD3P0DP91 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CSB-PGBD3P0DP91 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CSB-PGBD3P0DP91 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CSB-PGBD3P0DP91 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CSB-PGBD3P0DP91 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CSB-PGBD3P0DP91 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CSB-PGBD3P0DP91 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CSB-PGBD3P0DP91 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CSB-PGBD3P0DP91 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CSB-PGBD3P0DP91 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CSB-PGBD3P0DP91 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CSB-PGBD3P0DP91 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CSB-PGBD3P0DP91 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CSB-PGBD3P0DP91 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CSB-PGBD3P0DP91 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CSB-PGBD3P0DP91 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CSB-PGBD3P0DP91 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CSB-PGBD3P0DP91 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CSB-PGBD3P0DP91 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CSB-PGBD3P0DP91 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CSB-PGBD3P0DP91 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CSB-PGBD3P0DP91 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CSB-PGBD3P0DP91 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CSB-PGBD3P0DP91 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CSB-PGBD3P0DP91 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CSB-PGBD3P0DP91 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CSB-PGBD3P0DP91 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CSB-PGBD3P0DP91 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CSB-PGBD3P0DP91 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CSB-PGBD3P0DP91 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CSB-PGBD3P0DP91 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CSB-PGBD3P0DP91 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CSB-PGBD3P0DP91 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CSB-PGBD3P0DP91 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CSB-PGBD3P0DP91 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CSB-PGBD3P0DP91 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CSB-PGBD3P0DP91 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CSB-PGBD3P0DP91 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CSB-PGBD3P0DP91 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CSB-PGBD3P0DP91 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CSB-PGBD3P0DP91 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CSB-PGBD3P0DP91 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CSB-PGBD3P0DP91 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CSB-PGBD3P0DP91 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CSB-PGBD3P0DP91 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CSB-PGBD3P0DP91 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CSB-PGBD3P0DP91 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CSB-PGBD3P0DP91 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CSB-PGBD3P0DP91 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CSB-PGBD3P0DP91 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CSB-PGBD3P0DP91 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CSB-PGBD3P0DP91 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CSB-PGBD3P0DP91 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CSB-PGBD3P0DP91 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CSB-PGBD3P0DP91 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CSB-PGBD3P0DP91 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CSB-PGBD3P0DP91 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSB-PGBD3P0DP91 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSB-PGBD3P0DP91 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSB-PGBD3P0DP91 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSB-PGBD3P0DP91 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSB-PGBD3P0DP91 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSB-PGBD3P0DP91 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSB-PGBD3P0DP91 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSB-PGBD3P0DP91 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSB-PGBD3P0DP91 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSB-PGBD3P0DP91 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSB-PGBD3P0DP91 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSB-PGBD3P0DP91 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSB-PGBD3P0DP91 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSB-PGBD3P0DP91 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSB-PGBD3P0DP91 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CSB-PGBD3P0DP91 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms