Protein–RNA interactions for Protein: P0DP25

CALM3, Calmodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALM3P0DP25 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CALM3P0DP25 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CALM3P0DP25 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CALM3P0DP25 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALM3P0DP25 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALM3P0DP25 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALM3P0DP25 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALM3P0DP25 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALM3P0DP25 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALM3P0DP25 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALM3P0DP25 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALM3P0DP25 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALM3P0DP25 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALM3P0DP25 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALM3P0DP25 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALM3P0DP25 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALM3P0DP25 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALM3P0DP25 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CALM3P0DP25 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CALM3P0DP25 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CALM3P0DP25 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CALM3P0DP25 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CALM3P0DP25 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CALM3P0DP25 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CALM3P0DP25 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CALM3P0DP25 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CALM3P0DP25 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CALM3P0DP25 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CALM3P0DP25 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CALM3P0DP25 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CALM3P0DP25 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CALM3P0DP25 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CALM3P0DP25 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CALM3P0DP25 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CALM3P0DP25 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CALM3P0DP25 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CALM3P0DP25 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CALM3P0DP25 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CALM3P0DP25 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CALM3P0DP25 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CALM3P0DP25 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CALM3P0DP25 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CALM3P0DP25 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CALM3P0DP25 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CALM3P0DP25 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CALM3P0DP25 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CALM3P0DP25 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CALM3P0DP25 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CALM3P0DP25 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CALM3P0DP25 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CALM3P0DP25 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CALM3P0DP25 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CALM3P0DP25 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CALM3P0DP25 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CALM3P0DP25 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CALM3P0DP25 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALM3P0DP25 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALM3P0DP25 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALM3P0DP25 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALM3P0DP25 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALM3P0DP25 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALM3P0DP25 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALM3P0DP25 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALM3P0DP25 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALM3P0DP25 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALM3P0DP25 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALM3P0DP25 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALM3P0DP25 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALM3P0DP25 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALM3P0DP25 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALM3P0DP25 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALM3P0DP25 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALM3P0DP25 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALM3P0DP25 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALM3P0DP25 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALM3P0DP25 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CALM3P0DP25 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CALM3P0DP25 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CALM3P0DP25 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CALM3P0DP25 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CALM3P0DP25 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CALM3P0DP25 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CALM3P0DP25 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CALM3P0DP25 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CALM3P0DP25 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CALM3P0DP25 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CALM3P0DP25 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CALM3P0DP25 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CALM3P0DP25 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CALM3P0DP25 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CALM3P0DP25 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CALM3P0DP25 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CALM3P0DP25 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CALM3P0DP25 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CALM3P0DP25 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CALM3P0DP25 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CALM3P0DP25 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CALM3P0DP25 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CALM3P0DP25 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CALM3P0DP25 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms