Protein–RNA interactions for Protein: P0DJJ0

SRGAP2C, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2CP0DJJ0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRGAP2CP0DJJ0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRGAP2CP0DJJ0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRGAP2CP0DJJ0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRGAP2CP0DJJ0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRGAP2CP0DJJ0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRGAP2CP0DJJ0 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRGAP2CP0DJJ0 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRGAP2CP0DJJ0 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRGAP2CP0DJJ0 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRGAP2CP0DJJ0 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRGAP2CP0DJJ0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRGAP2CP0DJJ0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRGAP2CP0DJJ0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRGAP2CP0DJJ0 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRGAP2CP0DJJ0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRGAP2CP0DJJ0 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRGAP2CP0DJJ0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRGAP2CP0DJJ0 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRGAP2CP0DJJ0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRGAP2CP0DJJ0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRGAP2CP0DJJ0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRGAP2CP0DJJ0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SRGAP2CP0DJJ0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRGAP2CP0DJJ0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRGAP2CP0DJJ0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRGAP2CP0DJJ0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRGAP2CP0DJJ0 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRGAP2CP0DJJ0 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SRGAP2CP0DJJ0 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRGAP2CP0DJJ0 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRGAP2CP0DJJ0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SRGAP2CP0DJJ0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRGAP2CP0DJJ0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRGAP2CP0DJJ0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRGAP2CP0DJJ0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRGAP2CP0DJJ0 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRGAP2CP0DJJ0 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRGAP2CP0DJJ0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRGAP2CP0DJJ0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRGAP2CP0DJJ0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRGAP2CP0DJJ0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRGAP2CP0DJJ0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRGAP2CP0DJJ0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRGAP2CP0DJJ0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRGAP2CP0DJJ0 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRGAP2CP0DJJ0 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRGAP2CP0DJJ0 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRGAP2CP0DJJ0 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRGAP2CP0DJJ0 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SRGAP2CP0DJJ0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRGAP2CP0DJJ0 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRGAP2CP0DJJ0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRGAP2CP0DJJ0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRGAP2CP0DJJ0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRGAP2CP0DJJ0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRGAP2CP0DJJ0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRGAP2CP0DJJ0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRGAP2CP0DJJ0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SRGAP2CP0DJJ0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRGAP2CP0DJJ0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRGAP2CP0DJJ0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRGAP2CP0DJJ0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRGAP2CP0DJJ0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRGAP2CP0DJJ0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRGAP2CP0DJJ0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRGAP2CP0DJJ0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRGAP2CP0DJJ0 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRGAP2CP0DJJ0 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SRGAP2CP0DJJ0 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRGAP2CP0DJJ0 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SRGAP2CP0DJJ0 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRGAP2CP0DJJ0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRGAP2CP0DJJ0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRGAP2CP0DJJ0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRGAP2CP0DJJ0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SRGAP2CP0DJJ0 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRGAP2CP0DJJ0 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRGAP2CP0DJJ0 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRGAP2CP0DJJ0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRGAP2CP0DJJ0 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SRGAP2CP0DJJ0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRGAP2CP0DJJ0 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRGAP2CP0DJJ0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRGAP2CP0DJJ0 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRGAP2CP0DJJ0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRGAP2CP0DJJ0 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRGAP2CP0DJJ0 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRGAP2CP0DJJ0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRGAP2CP0DJJ0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRGAP2CP0DJJ0 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRGAP2CP0DJJ0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRGAP2CP0DJJ0 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRGAP2CP0DJJ0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRGAP2CP0DJJ0 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRGAP2CP0DJJ0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRGAP2CP0DJJ0 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRGAP2CP0DJJ0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRGAP2CP0DJJ0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRGAP2CP0DJJ0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms